生物安全柜主要用于保護進行生物實驗的操作人員。對于一些進行生物培養和菌類培養實驗常常會產生一些污染物，這些污染物不能隨便進行排放，生物安全柜的出現很好的解決了這一問題。正確的使用生物安全柜可以保護實驗者的同時也能很好的解決生物污染的排放問題。當然這一切是建立在正確選購和使用的前提下，安全柜有很多種，包括生物安全柜和超凈工作臺。

生物安全柜的選擇類型取決于生物實驗類型：

1、實驗中如果只有微生物樣品，那么可以使用基本類型的生物安全柜；

2、如果生物實驗中涉及了微生物樣品和微量化學試劑(非腐蝕性)，使用裝備外排管道的安全柜是必要的。因為HEPA過濾器并不能有效過濾清除化學氣體，如果不能外排，將對實驗室內工作人員和環境造成威脅； 

3、如果生物實驗中涉及了細胞毒素類藥物，例如各類癌癥治療藥物，必須使用的細胞毒素安全柜。 

生物安全柜與通風柜/超凈工作臺都屬于安全柜類別，但通風柜和超凈工作臺不屬于生物安全柜，因為兩種安全柜不可在涉及微生物的實驗中使用。

超凈工作臺是為了保護實驗品或產品而設計的，通過吹過工作區域的垂直或水平層流空氣防止實驗品或產品受到工作區域外粉塵或細菌的污染。一旦微生物樣品放置于工作區域，層流空氣將把帶有微生物介質的空氣吹向前臺工作人員而產生危險。